Вопрос
Окно ESSO-аутентификации появляется при запуске целевого приложения для пользователей Active Directory без учётных записей ESSO для данного приложения.
В конфигурации приложения установлена настройка "Только Indeed ESSO Агент".

Ответ
Если стоит настройка "Только Indeed ESSO Агент", это означает, что приложение является бизнес-критичным и вне зависимости ни от чего (если учётная запись ESSO для пользователя Active Directory или нет), нельзя ходить в него по паролю, если у пользователя установлен Indeed ESSO Агент.
Типичный сценарий - офицер безопасности расставляет галочки на уровне приложений и ему нет дела, есть там учётные записи или нету, этим уже занимаются администраторы.